شورای راهبری مؤسسه آموزش عالی حوزوی امام رضا علیه السلام متشکل از ریاست مؤسسه، مدیریت و معاونت های آموزش و پژوهش بوده و عهده دار تصمیم گیری در خصوص موضوعات و امور ساختاری، سازمانی، اجرایی، مدیریتی و زیرساختی می باشد:
این شورا متشکل از افراد زیر است:
- آیت الله علی اکبر رشاد / ریاست مؤسسه
- حجت الاسلام والمسلمین دکتر ذبیح الله نعیمیان / مدیر مؤسسه
- دکتر مرتضی خرامی / معاون آموزش
- حجت الاسلام والمسلمین عباسعلی مشکانی سبزواری / معاون پژوهش